Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3298E9PW80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3298E9PW80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3298E9PW80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3298E9PW80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3298E9PW80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3298E9PW80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms