Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam46aD3Z5S8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46aD3Z5S8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46aD3Z5S8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46aD3Z5S8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms