Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pgbd5D3YZI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pgbd5D3YZI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pgbd5D3YZI9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd5D3YZI9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd5D3YZI9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgbd5D3YZI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgbd5D3YZI9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgbd5D3YZI9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgbd5D3YZI9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms