Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
1500009C09RikD3YYW9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1500009C09RikD3YYW9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1500009C09RikD3YYW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1500009C09RikD3YYW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms