Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd1D3YXK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Samd1D3YXK1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Samd1D3YXK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samd1D3YXK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms