Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rexo5D3YW29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rexo5D3YW29 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rexo5D3YW29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rexo5D3YW29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rexo5D3YW29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms