Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3259D3YUK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3259D3YUK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3259D3YUK0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3259D3YUK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms