Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mfap1bC0HKD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mfap1bC0HKD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mfap1bC0HKD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mfap1bC0HKD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mfap1bC0HKD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms