Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smok3bC0HKC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smok3bC0HKC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smok3bC0HKC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smok3bC0HKC9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smok3bC0HKC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms