Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700006A11RikB9EHI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700006A11RikB9EHI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
1700006A11RikB9EHI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700006A11RikB9EHI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
1700006A11RikB9EHI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms