Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm20547B8JJN0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20547B8JJN0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20547B8JJN0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20547B8JJN0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20547B8JJN0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20547B8JJN0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20547B8JJN0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20547B8JJN0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms