Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71aB7XG49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71aB7XG49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71aB7XG49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71aB7XG49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71aB7XG49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam71aB7XG49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71aB7XG49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71aB7XG49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71aB7XG49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam71aB7XG49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms