Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pnldc1B2RXZ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnldc1B2RXZ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnldc1B2RXZ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnldc1B2RXZ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms