Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah3B2RWG3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah3B2RWG3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah3B2RWG3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms