Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7aB2RT54 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apol7aB2RT54 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apol7aB2RT54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Apol7aB2RT54 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms