Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud3B1AZ99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud3B1AZ99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud3B1AZ99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud3B1AZ99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms