Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Spocd1B1ASB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spocd1B1ASB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spocd1B1ASB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spocd1B1ASB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Spocd1B1ASB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms