Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AgrnA2ASQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AgrnA2ASQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AgrnA2ASQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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