Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
GabreA2AMW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
GabreA2AMW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
GabreA2AMW3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,8■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
GabreA2AMW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27,75■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
GabreA2AMW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
GabreA2AMW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
GabreA2AMW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,7 ms