Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbbp8nlA2ABX0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms