Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hivep3A2A884 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hivep3A2A884 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hivep3A2A884 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms