Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc27A2A6Q5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdc27A2A6Q5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdc27A2A6Q5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc27A2A6Q5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc27A2A6Q5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms