Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo47A2A6H3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo47A2A6H3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo47A2A6H3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo47A2A6H3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms