Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam171a2A2A699 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171a2A2A699 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171a2A2A699 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171a2A2A699 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171a2A2A699 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam171a2A2A699 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms