Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms