Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RNP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0U1RNP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RNP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RNP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RNP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms