Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv30A0A0B4J1P1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv30A0A0B4J1P1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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