Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv21A0A0A6YX06 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv21A0A0A6YX06 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv21A0A0A6YX06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv21A0A0A6YX06 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv21A0A0A6YX06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv21A0A0A6YX06 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv21A0A0A6YX06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Trbv21A0A0A6YX06 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Trbv21A0A0A6YX06 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Trbv21A0A0A6YX06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv21A0A0A6YX06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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