Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B020011L13RikA0A087WQI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B020011L13RikA0A087WQI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020011L13RikA0A087WQI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms