Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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