Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOGA3Q5TF21 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms