Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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