Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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