Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms