Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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