Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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