Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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TCOF1Q13428 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCOF1Q13428 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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