Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATMQ13315 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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