Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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