Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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GRIK3Q13003 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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GRIK3Q13003 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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GRIK3Q13003 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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GRIK3Q13003 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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