Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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