Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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