Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms