Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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