Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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