Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRIQ1Q96JM4 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LRRIQ1Q96JM4 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms