Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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