Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IMPG1Q17R60 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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