Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIST2H2ACQ16777 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms