Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms